科研开发是企业发展、做强做大的基础和源动力，是普洛医药一直以来的一项工作重点。2002年，普洛医药的研发中心被评为省级企业技术中心，2006年被国家科技部等五部委联合认定为“国家级企业技术中心”。此外，普洛医药还与中科院成都有机所共建了“手性药物及中间体技术国家工程研究中心”，在国内手性药物、中间体开发及生物技术领域具有突出的实力。
随着全球经济一体化进程的加快及我国加入世界贸易组织，我国医药产业面临更加激烈的市场竞争和挑战。普洛家园一直坚持“自主创新”的发展宗旨，不断加大科技投资力度，提高产品的科技含量，降低生产成本，将从目前的生产经营企业逐步转变为以研发与市场为中心的现代企业模式。研发中心以改进研发作为主体任务（包括新产品与已有产品的二次开发），并与外围科研机构以及国外医药企业逐步尝试创新研发工作，并有重点有选择地开始创新产品的开发。
公司的研究大楼位于普洛医药的总部，建筑面积达6000平方米，设施先进、配套完备。技术中心下设技术部、开发部、信息情报部、分析测试部、工程转化部。技术中心现有人员228人，其中具有博士学位18人、硕士学位45人。此外，公司与许多著名的大学有密切的合作，通过合同实验，利用高校的先进的大型仪器来开展更精密的科研实验。
2007年经浙江省人事厅批准，普洛医药设立省级企业博士后科研工作站。目前已经先后有2名博士入站，主要从事新产品的研究。公司给博士后们提供了良好的科研开发和学术交流环境。